28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4746 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  100 
 
 
503 aa  1033    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  30.4 
 
 
514 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  31.3 
 
 
515 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  33.65 
 
 
496 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  29.06 
 
 
548 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  29.41 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  28.24 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  28.24 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  28.65 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  27.18 
 
 
971 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  30.26 
 
 
534 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  26.12 
 
 
506 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  42.67 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  42.67 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  26.51 
 
 
281 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  49.12 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  29.53 
 
 
874 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  30.91 
 
 
412 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  31.21 
 
 
345 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  34.43 
 
 
300 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  42.62 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  27.92 
 
 
279 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  40.98 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  28.57 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.89 
 
 
690 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  24.78 
 
 
904 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  34.43 
 
 
666 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  29 
 
 
369 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>