26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1947 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  58.57 
 
 
495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  43.88 
 
 
247 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  43.88 
 
 
247 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  37.58 
 
 
300 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  34.81 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  39.78 
 
 
971 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  38.29 
 
 
874 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  31.75 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  30.47 
 
 
412 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  29.2 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  29.97 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  25.99 
 
 
496 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  27.92 
 
 
503 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  42.86 
 
 
515 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  25.41 
 
 
514 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  32.38 
 
 
850 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  47.17 
 
 
536 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  47.17 
 
 
536 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  23.48 
 
 
546 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  28.4 
 
 
904 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 
340 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  25.26 
 
 
493 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  24.75 
 
 
534 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  38.98 
 
 
566 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  23.05 
 
 
542 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>