17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4643 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  100 
 
 
599 aa  1230    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.91 
 
 
690 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  24.8 
 
 
536 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  24.8 
 
 
536 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  25.12 
 
 
542 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  26.62 
 
 
534 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  40.98 
 
 
503 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  24.01 
 
 
535 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  23.55 
 
 
566 aa  53.9  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  23.08 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  23.32 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  23.08 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  21.86 
 
 
850 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  24.11 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  23.78 
 
 
548 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  39.68 
 
 
247 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  39.68 
 
 
247 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>