14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40017 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  100 
 
 
546 aa  1129    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  26.07 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
340 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0799455 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  23.74 
 
 
247 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  23.74 
 
 
247 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05311  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  24.58 
 
 
383 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00354279  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01318  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  30.95 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  23.48 
 
 
279 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  23.36 
 
 
281 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  23.83 
 
 
514 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  23.83 
 
 
515 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  27.91 
 
 
416 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  23.46 
 
 
300 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>