30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3428 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  100 
 
 		 139 aa  273  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  28.99 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30.69 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  28.89 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  29.45 
 
 		 331 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  43.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 		 142 aa  43.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  22.31 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  27.94 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.64 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  28.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  32.5 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  29.25 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.07 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  33.58 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.12 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  30.61 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1177  protein of unknown function DUF1486  26.8 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.266373  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 		 402 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  23.86 
 
 		 150 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  24.24 
 
 		 138 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>