36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3220 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  41.27 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  45.98 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  46.34 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  44.58 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 115 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  34.48 
 
 		 113 aa  47.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 121 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 134 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  40.45 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  28.71 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  32.11 
 
 		 127 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 115 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 140 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 175 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 124 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 119 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  29.7 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  29.13 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  31.63 
 
 		 113 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0277  transcriptional regulator, HxlR family  29.79 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 		 120 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>