36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2142 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.93 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  50.79 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  45.66 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.66 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.66 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  38.29 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.46 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.91 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.35 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  40.21 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  38.13 
 
 		 328 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.57 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.2 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  38.85 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.16 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.17 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.64 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  22.99 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  30.37 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.01 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 271 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.6 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.56 
 
 		 345 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  25 
 
 		 144 aa  42  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>