More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0729 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0729  isoleucine patch superfamily acetyltransferase  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.831376  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5884  putative acetyltransferase  85.71 
 
 
224 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2373  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.97 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0078  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.41 
 
 
244 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0470  hexapeptide repeat-containing transferase  26.37 
 
 
199 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.32 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2637  hexapaptide repeat-containing transferase  33.89 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  43.07 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  43.07 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  36.13 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.22 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3285  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  38.89 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1896  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.52 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0264  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.4 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.654508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1510  acetyltransferase  33.62 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00118654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  30.05 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  59.38 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0849  thiogalactoside acetyltransferase  34.56 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.148081  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  42.72 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0446  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  33.57 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  52.17 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  35.59 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1824  hexapaptide repeat-containing transferase  45.56 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279284  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  37.93 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2881  putative acetyltransferase  34.09 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  44.21 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  40.54 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  51.56 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6403  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.79 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.552985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  29.76 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.62 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  38.05 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0407  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.08 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  30.52 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  43.12 
 
 
184 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0639  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.23 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3507  acetyltransferase  35.56 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.58 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  33.08 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  60 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3167  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.39 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3219  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.282397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3680  acetyltransferase  32.9 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1611  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.3 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.852212  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1294  galactoside O-acetyltransferase 3; maltose O-acetyltransferase 3  44.21 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.356111  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  61.54 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  45.31 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1833  hexapaptide repeat-containing transferase  41.05 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00362387  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  41.84 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  41.84 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2125  putative sugar acetyltransferase  42.06 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  41.07 
 
 
571 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  42.86 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  60.71 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  56.36 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  50.7 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  50.85 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  50.85 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  39.78 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  41.76 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  54.24 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  63.46 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  35.78 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  63.46 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  46.67 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  45.56 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  35.4 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  37.74 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2976  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  40 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  64.71 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1182  acetyltransferase, putative  39.45 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.142998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3267  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  32.14 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344923  normal  0.024173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.14 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0859  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  37.5 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207251  normal  0.0554952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  35.34 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0688  acetyltransferase  32.38 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  41.3 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.61 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.52 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  37.07 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.76 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  40.35 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  57.69 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  58.82 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2983  acetyltransferase  36.96 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.833594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  36.44 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  34.88 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  55.77 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  32.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  47.95 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.85 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  30.16 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  40.19 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  45.31 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.08 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.07 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  47.19 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>