29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1132 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1132  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1221  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0405  transcriptional regulator, XRE family  51.91 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4149  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00609324  hitchhiker  0.00863395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3858  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793488  normal  0.0443892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0535  transcriptional regulator  43.41 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00965435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0887  helix-turn-helix DNA binding domain-containing protein  48.41 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  38.79 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0666  XRE family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1635  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3278  hypothetical protein  33.6 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  36.59 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3331  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.925348  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04261  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3671  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.538584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5900  hypothetical protein  39.39 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 459 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 97 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4934  hypothetical protein  37.88 
 
 		 87 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 67 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  43.14 
 
 		 352 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0355  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1091  hypothetical protein  28.71 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>