46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0388 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  45.1 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  44.79 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  39.22 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  39.22 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  34.31 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  32.35 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  32.35 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  32.14 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  34.12 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  29.89 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  30.53 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  30.53 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  29.49 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  37.5 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  23.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  28.38 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  28.57 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  32.89 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.47 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  28.89 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  26.67 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  22.22 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  29.09 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  25.56 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  29.89 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  24.75 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  24.69 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  25.68 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  23.46 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  23.46 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  27.78 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  23.68 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  28.77 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  24.71 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  29.41 
 
 		 94 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  22.22 
 
 		 95 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  31.46 
 
 		 111 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  32.35 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  34.25 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  32.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  26.19 
 
 		 95 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>