24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0818 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1093    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  25.45 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  26.72 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  24.09 
 
 		 626 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  22.95 
 
 		 656 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  21.57 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  21.21 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  21.74 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  22.51 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  22.49 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  24.45 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  21.62 
 
 		 686 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  21.32 
 
 		 606 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  21.32 
 
 		 606 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  21.32 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  21.47 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  27.42 
 
 		 607 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 679 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  31.82 
 
 		 661 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  29.24 
 
 		 598 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  23.62 
 
 		 498 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>