More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0505 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0505  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 340 aa  682    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0426795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.21 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.89 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.89 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  57.01 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 345 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.28 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.67 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.82 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.85 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.98 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.85 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.12 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.24 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.24 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.48 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.48 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.51 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0997  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>