28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0060 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  587  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  97.52 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  38.21 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  38.41 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  34.93 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  38.27 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  37.96 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  38.08 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  39.13 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  38.01 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  35.77 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  37.27 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  37.13 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  36.82 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  33.7 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  34.18 
 
 		 327 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.5 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  34.3 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  42.59 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  42.59 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.28 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  29.63 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1886  hypothetical protein  24.91 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>