27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0280 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  755    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  30.69 
 
 		 191 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  33.74 
 
 		 187 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  27.38 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  27.16 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  29.58 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  29.11 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  30.92 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  31.21 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  31.2 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  28.34 
 
 		 220 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0281  hypothetical protein  37.93 
 
 		 237 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0206405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  36.08 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  28.81 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  28 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  27.22 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  27.91 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.67 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  26.42 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>