28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0055 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  100 
 
 
141 aa  298  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  95.74 
 
 
141 aa  286  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  95.04 
 
 
141 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  92.2 
 
 
141 aa  275  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  91.49 
 
 
141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  39.39 
 
 
134 aa  87  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  33.82 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  34.29 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.21 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  40.91 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  34.56 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  34.29 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  42.86 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  32.33 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  31.39 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  28.57 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  31.62 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  28.68 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  29.1 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  28.87 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  31.34 
 
 
152 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  27.66 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  27.59 
 
 
159 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  30.56 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  26.81 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  26.76 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  27.66 
 
 
159 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  26.76 
 
 
161 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>