20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02842 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  92.57 
 
 		 1520 aa  2815    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  100 
 
 		 1517 aa  3149    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  92.5 
 
 		 1518 aa  2823    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  37.58 
 
 		 1426 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  90.71 
 
 		 1506 aa  2727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  92.22 
 
 		 1503 aa  2787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  48.67 
 
 		 1443 aa  1367    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  100 
 
 		 1517 aa  3149    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0727  hypothetical protein  80.42 
 
 		 143 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  27.46 
 
 		 785 aa  99.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  27.12 
 
 		 660 aa  93.2  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  19.91 
 
 		 770 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 202 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  36.05 
 
 		 529 aa  47.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  55.56 
 
 		 268 aa  47.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  23.5 
 
 		 827 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  53.06 
 
 		 444 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.72 
 
 		 288 aa  45.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.11 
 
 		 433 aa  45.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0348  TonB-like protein  50 
 
 		 67 aa  45.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00176132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>