18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2273 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  47.27 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  39.91 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  36.76 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  32.18 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  25.84 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  22.56 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  22.56 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  24.04 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  24.7 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  30.56 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  26.96 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  23.42 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  30.28 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  22.63 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  31.65 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  24.52 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>