47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0680 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  83.55 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  67.39 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  35.78 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  41.49 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  24.03 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  21.98 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  37.76 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  21.55 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  22.18 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  33.54 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  21.81 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  22.08 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  24.37 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  31.61 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  21.4 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  21.12 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.4 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  21.34 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  21.34 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  29.17 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  33.75 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  25.56 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  24.06 
 
 		 262 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  19.91 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  27.71 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  29.21 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>