180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0056 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  100 
 
 
379 aa  760    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2574  Osmosensitive K channel His kinase sensor  76.14 
 
 
375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  45.21 
 
 
553 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2617  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  48.5 
 
 
388 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1986  sensor kinase for the kdp operon  44.57 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169225  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1971  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  44.21 
 
 
374 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2504  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.08 
 
 
376 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.272614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0381  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  42.98 
 
 
371 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000830427  normal  0.0448438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0067  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.48 
 
 
374 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3612  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  41.76 
 
 
374 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633235  hitchhiker  0.000277552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  44.84 
 
 
926 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  43.28 
 
 
910 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
888 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  42.32 
 
 
885 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1154  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.26 
 
 
375 aa  264  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0108473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  41.13 
 
 
373 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
890 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  42.15 
 
 
370 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
900 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
901 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
961 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.6 
 
 
895 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.55 
 
 
377 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
892 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
907 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  42.32 
 
 
860 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  40.48 
 
 
905 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0896  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  39.41 
 
 
658 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000123785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  39.67 
 
 
381 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
850 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2088  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  42.9 
 
 
384 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.510085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  39.13 
 
 
384 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  41.99 
 
 
373 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  41.35 
 
 
895 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  41.35 
 
 
894 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0706  sensor histidine kinase KdpD  38.59 
 
 
382 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
907 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
836 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
836 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
894 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0742  sensor histidine kinase KdpD  38.59 
 
 
384 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
912 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  38.86 
 
 
381 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  38.86 
 
 
384 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
836 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0650  sensor histidine kinase  38.59 
 
 
384 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  39.13 
 
 
381 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0627  osmosensitive K channel His kinase sensor  39.4 
 
 
381 aa  248  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
894 aa  248  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
891 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1482  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.08 
 
 
731 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
894 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
905 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0649  sensor histidine kinase  38.32 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.831843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0818  sensor histidine kinase KdpD  38.32 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.23274e-52 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
894 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
895 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  41.06 
 
 
894 aa  245  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.24 
 
 
368 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.24 
 
 
368 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
951 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  42.07 
 
 
894 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  40.76 
 
 
894 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  39.61 
 
 
902 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.9 
 
 
853 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
905 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  41.77 
 
 
905 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  41.77 
 
 
894 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  41.77 
 
 
894 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  41.77 
 
 
894 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
902 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
897 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  41.64 
 
 
905 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
887 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
887 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  39.94 
 
 
908 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  42.62 
 
 
891 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  41.71 
 
 
365 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  39.94 
 
 
908 aa  240  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
938 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
947 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  40.71 
 
 
910 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
947 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
947 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
884 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  40.11 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
883 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
902 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
902 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
897 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  41.62 
 
 
370 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  41.94 
 
 
906 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
889 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  39.66 
 
 
908 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
895 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  41.59 
 
 
895 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
887 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0725  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.21 
 
 
391 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  39.04 
 
 
887 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
947 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>