More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2486 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
318 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 
298 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.971561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.19 
 
 
292 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.466037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
307 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.36 
 
 
295 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0828  ABC-type phosphate transport system, permease component  45.19 
 
 
294 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000218863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.51 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0777991  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.36 
 
 
289 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.78 
 
 
288 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.78 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.77 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.33 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.43 
 
 
604 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1558  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.48 
 
 
276 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  36.23 
 
 
627 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.8 
 
 
276 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2297  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.55 
 
 
279 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.3 
 
 
645 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0126  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.69 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.85 
 
 
293 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  39.48 
 
 
649 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.71 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.26 
 
 
294 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  37.08 
 
 
297 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.46 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.33 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.68 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.91 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.6 
 
 
646 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.77 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.4 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
283 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
286 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.02 
 
 
306 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.77 
 
 
314 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.57 
 
 
312 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.06 
 
 
282 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.74 
 
 
304 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
304 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.88 
 
 
290 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.59 
 
 
565 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  31.22 
 
 
281 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.32 
 
 
280 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3641  phosphate ABC transporter, permease protein  36.25 
 
 
545 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.29 
 
 
540 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.99 
 
 
286 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  30.03 
 
 
287 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  33.07 
 
 
303 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
278 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
478 aa  102  9e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3505  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.65 
 
 
298 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  30.03 
 
 
287 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  28.79 
 
 
278 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.8 
 
 
292 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
436 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.86 
 
 
304 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.4 
 
 
570 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2357  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.74 
 
 
293 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.39 
 
 
305 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.53 
 
 
291 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.1 
 
 
294 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.39 
 
 
305 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.32 
 
 
440 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.17 
 
 
436 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.75 
 
 
438 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.65 
 
 
288 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0420  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39 
 
 
304 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
307 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.71 
 
 
304 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.72 
 
 
291 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
440 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 
284 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.29 
 
 
440 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.55 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  34.44 
 
 
450 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0657  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.32 
 
 
532 aa  99.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.667392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.65 
 
 
419 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  35.42 
 
 
310 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2744  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.19 
 
 
550 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0855633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  28.41 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2547  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.67 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.96 
 
 
416 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  31.49 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  27.31 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  28.86 
 
 
715 aa  98.2  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.8 
 
 
940 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  27.31 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  35.15 
 
 
428 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004379  phosphate transport system permease protein PstA  33.85 
 
 
557 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3167  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.19 
 
 
550 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1502  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.19 
 
 
550 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125389  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01032  hypothetical protein  33.85 
 
 
557 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  27.31 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  27.31 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1699  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.41 
 
 
550 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.71 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.93 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>