More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0121 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  73.93 
 
 
436 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
440 aa  876    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  72.73 
 
 
438 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  76.82 
 
 
440 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0491  phosphate ABC transporter permease protein  79.21 
 
 
445 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  77.27 
 
 
440 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  73.22 
 
 
436 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1226  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  64.86 
 
 
430 aa  570  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.713602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1073  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  55.4 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  57.44 
 
 
450 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.87 
 
 
447 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2602  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  54.22 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2291  phosphate ABC transporter permease  56.85 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  53.72 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1260  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.22 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1921  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.84 
 
 
449 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1540  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.44 
 
 
432 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502175  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0600  phosphate ABC transporter permease  55.02 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.63 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.02 
 
 
433 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1233  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.27 
 
 
436 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.542864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1260  phosphate ABC transporter permease  55.11 
 
 
455 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2407  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstA-like protein  50.46 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3316  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.76 
 
 
441 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.35 
 
 
424 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3119  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.53 
 
 
456 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.851285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47 
 
 
386 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0466  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.11 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0824  phosphate ABC transporter permease  46.22 
 
 
418 aa  349  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8156  hitchhiker  0.00518788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.29 
 
 
389 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  42.31 
 
 
396 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  44.37 
 
 
428 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1478  phosphate ABC transporter permease  43.17 
 
 
388 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.94 
 
 
580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274847  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1857  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.43 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.65 
 
 
387 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.706579  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0644  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  40.48 
 
 
362 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0718  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  40.48 
 
 
362 aa  277  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1054  phosphate ABC transporter permease  39.76 
 
 
362 aa  273  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0799  phosphate ABC transporter, permease protein  40 
 
 
362 aa  269  8.999999999999999e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.650299  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0536  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.6 
 
 
421 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0492  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
422 aa  247  3e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1019  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  37.35 
 
 
416 aa  239  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.07 
 
 
424 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.83 
 
 
297 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.16 
 
 
416 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0479  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.77 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.289768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.1 
 
 
419 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.98 
 
 
293 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.26 
 
 
294 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.91 
 
 
307 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2360  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.64 
 
 
306 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.31 
 
 
305 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.31 
 
 
305 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.98 
 
 
565 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.22 
 
 
311 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.6 
 
 
295 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.72 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.74 
 
 
284 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0288  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.58 
 
 
306 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00554507  normal  0.233786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1087  phosphate ABC transporter permease  41.44 
 
 
310 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.58 
 
 
307 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.880653  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.06 
 
 
311 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 
306 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.33 
 
 
339 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3820  phosphate ABC transporter, permease component  43.72 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.06 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.16 
 
 
306 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  43.85 
 
 
299 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  45.76 
 
 
301 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  42.74 
 
 
303 aa  177  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.44 
 
 
588 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  41.73 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.53 
 
 
587 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
288 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
288 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.21 
 
 
288 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.93 
 
 
288 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.98 
 
 
540 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.15 
 
 
337 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3954  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.56 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.131574  normal  0.595733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  39.39 
 
 
288 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  39.39 
 
 
288 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  38.96 
 
 
288 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  38.96 
 
 
288 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0793  phosphate ABC transporter permease  43.02 
 
 
312 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.04 
 
 
294 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.42 
 
 
296 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.27 
 
 
284 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.67 
 
 
280 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.71 
 
 
305 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.16 
 
 
449 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.78 
 
 
284 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.85 
 
 
282 aa  146  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.17 
 
 
280 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  39.3 
 
 
297 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.39 
 
 
281 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>