More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1478 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1478  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
388 aa  783    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0466  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  62.77 
 
 
390 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1857  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.05 
 
 
389 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  59.15 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.17 
 
 
386 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  53.72 
 
 
396 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.93 
 
 
387 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.706579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1233  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.2 
 
 
436 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.542864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1540  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.23 
 
 
432 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502175  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  45.69 
 
 
430 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2407  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstA-like protein  46.06 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3316  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.44 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.79 
 
 
424 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1073  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  46.08 
 
 
434 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.88 
 
 
438 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0718  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  45.21 
 
 
362 aa  328  8e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.93 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.69 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.17 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.2 
 
 
433 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  42.06 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0644  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  45.74 
 
 
362 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0600  phosphate ABC transporter permease  44.1 
 
 
426 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.14 
 
 
430 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.06 
 
 
447 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1054  phosphate ABC transporter permease  45.74 
 
 
362 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1226  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.73 
 
 
430 aa  316  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.713602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.17 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0824  phosphate ABC transporter permease  43.56 
 
 
418 aa  312  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8156  hitchhiker  0.00518788 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0799  phosphate ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
362 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.650299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0491  phosphate ABC transporter permease protein  43.41 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3119  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.67 
 
 
456 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.851285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.78 
 
 
580 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274847  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2291  phosphate ABC transporter permease  49.84 
 
 
457 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1260  phosphate ABC transporter permease  41.01 
 
 
455 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1921  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.63 
 
 
449 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1260  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.58 
 
 
449 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2602  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  39.58 
 
 
449 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  40 
 
 
428 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1019  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  36.72 
 
 
416 aa  246  6.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.29 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0536  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.01 
 
 
421 aa  227  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.47 
 
 
311 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.67 
 
 
419 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.08 
 
 
311 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0479  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.5 
 
 
397 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.289768  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0492  putative phosphate ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
422 aa  224  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.61 
 
 
297 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
306 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.37 
 
 
311 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.06 
 
 
565 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.94 
 
 
294 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.98 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.66 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.93 
 
 
295 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.09 
 
 
305 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.09 
 
 
305 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  46.53 
 
 
303 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.37 
 
 
288 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  41.5 
 
 
312 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.53 
 
 
306 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1087  phosphate ABC transporter permease  42.97 
 
 
310 aa  199  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.82 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
288 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.44 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.57 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.55 
 
 
293 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.4 
 
 
307 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.880653  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0288  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.4 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00554507  normal  0.233786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 
301 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  40.24 
 
 
288 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  40.24 
 
 
288 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3954  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.57 
 
 
311 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.131574  normal  0.595733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  39.43 
 
 
288 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  39.43 
 
 
288 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.62 
 
 
587 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  42.8 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.93 
 
 
588 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.75 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.36 
 
 
337 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0793  phosphate ABC transporter permease  40.23 
 
 
312 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.09 
 
 
339 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.96 
 
 
540 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2360  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.43 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3820  phosphate ABC transporter, permease component  39.42 
 
 
290 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.52 
 
 
280 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.22 
 
 
284 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.39 
 
 
284 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
307 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.67 
 
 
283 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
283 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.91 
 
 
294 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
283 aa  149  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.79 
 
 
449 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.22 
 
 
305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>