More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1260 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1260  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
455 aa  908    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  66.51 
 
 
450 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.46 
 
 
447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1921  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  64.83 
 
 
449 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1260  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  61.27 
 
 
449 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2602  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  61.27 
 
 
449 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2291  phosphate ABC transporter permease  58.13 
 
 
457 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.68 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.78 
 
 
440 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.11 
 
 
440 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  53.59 
 
 
438 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  51.97 
 
 
436 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  51.53 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0491  phosphate ABC transporter permease protein  56.21 
 
 
445 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270109  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1226  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.35 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.713602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  49.1 
 
 
430 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1233  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.12 
 
 
436 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.542864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1073  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.58 
 
 
434 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.96 
 
 
430 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1540  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.18 
 
 
432 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502175  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.19 
 
 
433 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0600  phosphate ABC transporter permease  50.23 
 
 
426 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3316  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.33 
 
 
441 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3119  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.28 
 
 
456 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.851285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.48 
 
 
424 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2407  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstA-like protein  43.97 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.93 
 
 
386 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0824  phosphate ABC transporter permease  41.36 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8156  hitchhiker  0.00518788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0466  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.15 
 
 
390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1478  phosphate ABC transporter permease  41.01 
 
 
388 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1857  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.82 
 
 
389 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  40.75 
 
 
396 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.68 
 
 
580 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274847  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.12 
 
 
389 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  39.7 
 
 
428 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.91 
 
 
387 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.706579  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1054  phosphate ABC transporter permease  39.15 
 
 
362 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0718  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  38.68 
 
 
362 aa  252  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0799  phosphate ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
362 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.650299  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0644  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  38.68 
 
 
362 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1019  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  35.66 
 
 
416 aa  212  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.49 
 
 
297 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0536  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.09 
 
 
421 aa  211  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0492  putative phosphate ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
422 aa  205  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.58 
 
 
424 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.47 
 
 
419 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  41.67 
 
 
312 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.97 
 
 
293 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.53 
 
 
416 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  44.81 
 
 
306 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.15 
 
 
306 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.45 
 
 
311 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.45 
 
 
311 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2360  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.99 
 
 
306 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.36 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.08 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.13 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0479  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.6 
 
 
397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.289768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.29 
 
 
565 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.72 
 
 
305 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.72 
 
 
305 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1087  phosphate ABC transporter permease  38.66 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  42.23 
 
 
303 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0288  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.22 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00554507  normal  0.233786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  43.53 
 
 
299 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.04 
 
 
311 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.22 
 
 
307 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.880653  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.43 
 
 
295 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.39 
 
 
284 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0793  phosphate ABC transporter permease  42.64 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 
301 aa  170  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3954  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.11 
 
 
311 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.131574  normal  0.595733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.94 
 
 
587 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.99 
 
 
288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.45 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.22 
 
 
339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.74 
 
 
588 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
288 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
288 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.2 
 
 
540 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  30.95 
 
 
288 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  31.63 
 
 
288 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  31.63 
 
 
288 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
288 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
288 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  31.29 
 
 
288 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
288 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  31.29 
 
 
288 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3820  phosphate ABC transporter, permease component  39.36 
 
 
290 aa  152  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.36 
 
 
280 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.28 
 
 
296 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
284 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
283 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.94 
 
 
294 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.97 
 
 
449 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.82 
 
 
283 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4415  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.2 
 
 
570 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0704042  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  36.61 
 
 
627 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.29 
 
 
276 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>