More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3316 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3316  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
441 aa  895    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3753  phosphate ABC transporter, permease protein  63.72 
 
 
430 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1233  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  56.26 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.542864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2407  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstA-like protein  54.04 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1073  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  54.44 
 
 
434 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.31 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.091097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1540  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.52 
 
 
432 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502175  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0600  phosphate ABC transporter permease  54.8 
 
 
426 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0180  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.35 
 
 
440 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.407703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0170  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0769  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.39 
 
 
438 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00852875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2140  phosphate ABC transporter, permease protein  52.73 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0396  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.36 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.880767  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.45 
 
 
440 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2055  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  52.15 
 
 
436 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0491  phosphate ABC transporter permease protein  51.91 
 
 
445 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3119  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.6 
 
 
456 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.851285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4549  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.38 
 
 
433 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1226  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.64 
 
 
430 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.713602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1535  phosphate transport system permease protein  47.5 
 
 
450 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.55409  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4328  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.53 
 
 
447 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0466  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46 
 
 
390 aa  362  8e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0499  phosphate ABC transporter permease  44.82 
 
 
396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1478  phosphate ABC transporter permease  44.44 
 
 
388 aa  356  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1260  phosphate ABC transporter permease  46.33 
 
 
455 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.93 
 
 
386 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232883  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1921  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.04 
 
 
449 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2291  phosphate ABC transporter permease  45.96 
 
 
457 aa  345  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1260  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.44 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2602  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstA  44.44 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1857  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.27 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.27 
 
 
387 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.706579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.47 
 
 
389 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0824  phosphate ABC transporter permease  44.39 
 
 
418 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8156  hitchhiker  0.00518788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  62.64 
 
 
580 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274847  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2278  phosphate ABC transporter permease  45.7 
 
 
428 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287967  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0718  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  51.6 
 
 
362 aa  292  9e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0644  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  51.6 
 
 
362 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1054  phosphate ABC transporter permease  51.25 
 
 
362 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0799  phosphate ABC transporter, permease protein  51.54 
 
 
362 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.650299  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0536  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.84 
 
 
421 aa  268  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0492  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
422 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1019  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  37.98 
 
 
416 aa  253  3e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0479  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  44.62 
 
 
397 aa  237  4e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.289768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.79 
 
 
297 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4155  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.14 
 
 
424 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.740309  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.54 
 
 
305 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.54 
 
 
305 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.54 
 
 
284 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.38 
 
 
307 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.64 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0587  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.38 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.54 
 
 
294 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1097  phosphate ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 
306 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1051  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.56 
 
 
311 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.0000167786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3564  phosphate ABC transporter permease  45.72 
 
 
312 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1022  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.16 
 
 
311 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1656  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.75 
 
 
306 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3637  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.84 
 
 
311 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103396  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.63 
 
 
293 aa  206  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1791  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.19 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0380745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1087  phosphate ABC transporter permease  45.38 
 
 
310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0958  phosphate ABC transporter, permease protein  48.09 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1251  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.64 
 
 
295 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.24 
 
 
288 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  41.81 
 
 
288 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
288 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.24 
 
 
288 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4494  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.53 
 
 
312 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3954  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.82 
 
 
311 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.131574  normal  0.595733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  42.24 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  42.24 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  41.81 
 
 
288 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  41.38 
 
 
288 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  41.38 
 
 
288 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2442  phosphate ABC transporter permease  43.85 
 
 
303 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.666961  hitchhiker  0.00775863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0047  phosphate ABC transporter permease  45.76 
 
 
299 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.519128  normal  0.369042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 
288 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 
288 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2360  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.51 
 
 
306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3820  phosphate ABC transporter, permease component  45.26 
 
 
290 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0793  phosphate ABC transporter permease  42.69 
 
 
312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0288  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.36 
 
 
306 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00554507  normal  0.233786 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0355  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.74 
 
 
540 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00446882  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.36 
 
 
307 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.880653  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0492  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44 
 
 
337 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.9 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.99 
 
 
588 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569683  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.34 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2480  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.06 
 
 
296 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.76 
 
 
294 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.66 
 
 
288 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.77 
 
 
284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.43 
 
 
284 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.59 
 
 
280 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.41 
 
 
276 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.56 
 
 
282 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  39.01 
 
 
283 aa  143  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.58 
 
 
306 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  36.02 
 
 
649 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>