More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2263 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
506 aa  1026    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  70.59 
 
 
495 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  64.68 
 
 
455 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  64.55 
 
 
454 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  50.62 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  45.79 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.14 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  39.52 
 
 
495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
441 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.06 
 
 
438 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 
439 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  37.91 
 
 
439 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  38.78 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  37.94 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
443 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  39.14 
 
 
448 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  35.88 
 
 
445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  36.33 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  39 
 
 
434 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.85 
 
 
442 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  37.7 
 
 
494 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  38.43 
 
 
443 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
473 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  37.7 
 
 
493 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.35 
 
 
447 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 
449 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 
449 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 
441 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  37.65 
 
 
449 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  34.56 
 
 
441 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 
442 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 
498 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  35.04 
 
 
441 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  35.66 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
446 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  38.84 
 
 
467 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 
438 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  34.92 
 
 
567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  38.85 
 
 
438 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  37.35 
 
 
498 aa  289  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  35.14 
 
 
436 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  35.88 
 
 
490 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  36.08 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  36.16 
 
 
439 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
445 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  35.37 
 
 
440 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  38.49 
 
 
471 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  34.57 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  35.94 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  33.54 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  34.84 
 
 
436 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  34.84 
 
 
436 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  35.31 
 
 
464 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  34.5 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  35.02 
 
 
441 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  35.45 
 
 
445 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  36.21 
 
 
499 aa  285  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  35.14 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  35.7 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  35.16 
 
 
440 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  32.39 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  34.01 
 
 
439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  37.15 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  35.29 
 
 
455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  38.22 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  36.02 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  37.01 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  37.09 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  37.7 
 
 
444 aa  283  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  37.15 
 
 
465 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
500 aa  282  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
481 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  36.21 
 
 
445 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  34.84 
 
 
446 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 
494 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 
465 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  36.71 
 
 
448 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  36.08 
 
 
445 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  36.08 
 
 
445 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  36.01 
 
 
445 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  36.01 
 
 
445 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  36.01 
 
 
445 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  36.01 
 
 
445 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 
472 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 
436 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  35.55 
 
 
443 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 
445 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  35.61 
 
 
473 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  34.75 
 
 
455 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
490 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>