24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0275 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  61.45 
 
 
250 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  51.25 
 
 
231 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  41.27 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  27.33 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25 
 
 
743 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
243 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  26.67 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
927 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
394 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
3145 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0745  tetratricopeptide domain-containing protein  23.33 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.473989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
1276 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  25.64 
 
 
815 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.04 
 
 
733 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
465 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
301 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>