50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2257 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2257  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 61 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  56.52 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0829  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000274329  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  42 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2431  FmdB family regulatory protein  41.18 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  45.24 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2262  hypothetical protein  43.18 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.545917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  41.86 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  34 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  36.73 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  40 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  34.69 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  36.07 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  36.54 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  35.71 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  38.78 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  34 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  46.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  40.3 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  38.78 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  46.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  32.31 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1468  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.337511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1269  FmdB family regulatory protein  41.67 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1245  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.265358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  36.54 
 
 		 73 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  38.78 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  36.73 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  40.48 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  40.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  36.54 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1941  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0534197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  38.33 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  36.54 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  39.22 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  36.17 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 73 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  36.73 
 
 		 78 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>