More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3113 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  100 
 
 		 321 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  61.11 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  59.76 
 
 		 326 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.64 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  57.59 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  57.81 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  57.5 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  57.5 
 
 		 319 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  57.5 
 
 		 319 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  57.19 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  57.19 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  56.88 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  57.1 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  57.1 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  56.25 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  56.35 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  54.8 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  54.8 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  56.41 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  55.03 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  54.11 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  58.26 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  54.69 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  56.25 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  56.88 
 
 		 319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  54.43 
 
 		 318 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  54.6 
 
 		 318 aa  362  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  54.43 
 
 		 318 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  55.41 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  55.66 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  53.63 
 
 		 335 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  54.43 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  53.63 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.63 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  53.63 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  53.63 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  53.94 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  52.55 
 
 		 320 aa  351  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  54.26 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  53 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  53 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  53 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  52.85 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  54.18 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  53.02 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  52.68 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  51.35 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  53.31 
 
 		 318 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  54.35 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  54.35 
 
 		 333 aa  342  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  53 
 
 		 318 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  54.04 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  51.56 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  51.89 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  52.35 
 
 		 323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  55.3 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.43 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.8 
 
 		 339 aa  328  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.66 
 
 		 318 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  53.77 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.58 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.69 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  49.84 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.29 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.3 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  47.5 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.97 
 
 		 315 aa  298  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.57 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  49.05 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  47.83 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  47.48 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.77 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.06 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.1 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.94 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  45.71 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  48.71 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.3 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.95 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  49.84 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  47.48 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  44.62 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  43.71 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  48.85 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  46.93 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  47.65 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.74 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  45.71 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.19 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.81 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  44.74 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  51.17 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  47.87 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>