More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1751 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
348 aa  706    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.61 
 
 
344 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.65 
 
 
346 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.05 
 
 
347 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
343 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.2 
 
 
343 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.07 
 
 
335 aa  339  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.55 
 
 
335 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.43 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.43 
 
 
357 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.94 
 
 
357 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.55 
 
 
357 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.45 
 
 
360 aa  269  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.06 
 
 
357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.28 
 
 
365 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.16 
 
 
347 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.45 
 
 
357 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.78 
 
 
350 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.11 
 
 
346 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.64 
 
 
345 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.64 
 
 
345 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.64 
 
 
345 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.24 
 
 
354 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40 
 
 
349 aa  235  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.66 
 
 
417 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.21 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
353 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.71 
 
 
349 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.21 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
344 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 
348 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.07 
 
 
350 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.55 
 
 
351 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.91 
 
 
353 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.36 
 
 
370 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.71 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.16 
 
 
350 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 
354 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.35 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.35 
 
 
379 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.29 
 
 
356 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
355 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
360 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
355 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.49 
 
 
336 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.94 
 
 
395 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.79 
 
 
358 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.47 
 
 
350 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.88 
 
 
334 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
356 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.34 
 
 
444 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  35.22 
 
 
352 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
386 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.66 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  35.33 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1954  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.07 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.14 
 
 
351 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.05 
 
 
351 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
350 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.11 
 
 
359 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.47 
 
 
349 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.03 
 
 
374 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.83 
 
 
350 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
383 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.85 
 
 
351 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
361 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.15 
 
 
351 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.83 
 
 
383 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.89 
 
 
360 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.9 
 
 
414 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
350 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.86 
 
 
351 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.08 
 
 
369 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.39 
 
 
376 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.86 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.86 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.41 
 
 
351 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
390 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
376 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.25 
 
 
359 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
391 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.46 
 
 
394 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.29 
 
 
382 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.53 
 
 
376 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
356 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.09 
 
 
356 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.65 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.24 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.36 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.26 
 
 
376 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
355 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.42 
 
 
376 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.31 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>