More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1430 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1430  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  991    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  62.96 
 
 		 487 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1974  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 		 486 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1254  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 		 481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4949  aldehyde dehydrogenase  58.42 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  57.61 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.61 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1251  Aldehyde Dehydrogenase  61.52 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2344  Aldehyde Dehydrogenase  56.74 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  57.27 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  57.05 
 
 		 478 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  56.83 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0776  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.26 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.141721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2350  aldehyde dehydrogenase  56.65 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.944535  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  55.48 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3585  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.863463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2664  aldehyde dehydrogenase  55 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0216707  normal  0.214781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  53.8 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1966  Aldehyde Dehydrogenase  55 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.150614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  54.78 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  54.33 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2290  aldehyde dehydrogenase  54.13 
 
 		 486 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2418  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  56.52 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2422  aldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1806  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4882  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.895119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5904  aldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5539  aldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0091  betaine-aldehyde dehydrogenase  55 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3004  aldehyde dehydrogenase  54.57 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3021  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 485 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143518  normal  0.755617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0735  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1077  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3006  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1235  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2278  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1083  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2463  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.32545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  55.43 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0874  aldehyde dehydrogenase  56.52 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2328  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1591  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2380  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1691  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0928  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.09 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  44.08 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.61 
 
 		 490 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.27 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.27 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.61 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.11 
 
 		 494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.67 
 
 		 494 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.48 
 
 		 498 aa  348  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.87 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.86 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.39 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 504 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 		 495 aa  339  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.2 
 
 		 493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 494 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 494 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 483 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  40.96 
 
 		 488 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.91 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.13 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 497 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.56 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.69 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.12 
 
 		 501 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.68 
 
 		 493 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 		 507 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.79 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.18 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 493 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>