283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0830 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  100 
 
 		 331 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  67.7 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  67.7 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  63.72 
 
 		 325 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  65.22 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  64.4 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  47.08 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  46.73 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  46.73 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  38.39 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  38.39 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  44.83 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  41.88 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  37.42 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  35.37 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  33.75 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  34.8 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  37.65 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  37.35 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  37.12 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  31.21 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  36.74 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  37.12 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  32.62 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  35.52 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  30.79 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  35.22 
 
 		 346 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  36.42 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  33.13 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.16 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  35.6 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  36.99 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  34.34 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  35.69 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  38.2 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  32.5 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  36.68 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  35.16 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  35.22 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  36.13 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  34.02 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  35.16 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  34.72 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  37.54 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  35.69 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  37.31 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  35.16 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  36.59 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  32.6 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  35.14 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  35.49 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  37.97 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  34.36 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  35.38 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  35.81 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  35.16 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  34.6 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  31.68 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  35.51 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  33.64 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  34.55 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  35.56 
 
 		 398 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  31.9 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  33.87 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  34.57 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  31.66 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  32.2 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  34.88 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  35.8 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  35.03 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  35.19 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  34.26 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  35.02 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  31.68 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  34.15 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  35.17 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  32.39 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  31.29 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  35.37 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>