More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0456 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  100 
 
 
318 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  66.04 
 
 
323 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  66.36 
 
 
323 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  64.29 
 
 
332 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.34 
 
 
330 aa  358  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  60.34 
 
 
330 aa  358  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.02 
 
 
331 aa  358  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  60.58 
 
 
345 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60 
 
 
335 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  61.86 
 
 
357 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.9 
 
 
338 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  54.55 
 
 
318 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  51.76 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  52.26 
 
 
347 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  50.93 
 
 
333 aa  311  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  51.94 
 
 
318 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  51.62 
 
 
319 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  53.09 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  50.16 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  52.92 
 
 
318 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  52.6 
 
 
318 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  49.23 
 
 
326 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  51.62 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  49.23 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  50.97 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  50.97 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  50.97 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.29 
 
 
319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  50.65 
 
 
319 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.32 
 
 
321 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  54.37 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  52.77 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.37 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  54.37 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  54.37 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  53.9 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  50.65 
 
 
319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  50.65 
 
 
319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  52.6 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  52.6 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  52.6 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  52.6 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  51.62 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  49.03 
 
 
323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  51.58 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  52.27 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  48.05 
 
 
319 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  51.27 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  52.85 
 
 
324 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  50.65 
 
 
319 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.5 
 
 
339 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  47.73 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.71 
 
 
332 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  45.66 
 
 
331 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.95 
 
 
332 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  50.83 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  45.48 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.41 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.53 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 
350 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  48.54 
 
 
325 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.83 
 
 
344 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
378 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  49.17 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  48.1 
 
 
333 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.95 
 
 
332 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  49.17 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  47.15 
 
 
333 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  47.15 
 
 
333 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  44.89 
 
 
335 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.89 
 
 
313 aa  267  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
325 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  43.83 
 
 
334 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.72 
 
 
322 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  47.51 
 
 
339 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.98 
 
 
350 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  47.37 
 
 
337 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  48.68 
 
 
326 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.34 
 
 
319 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  42.77 
 
 
333 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.08 
 
 
332 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  43.79 
 
 
328 aa  265  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.33 
 
 
342 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  47.02 
 
 
325 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  44.84 
 
 
316 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.64 
 
 
310 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
432 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  47.28 
 
 
321 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.75 
 
 
330 aa  263  4e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  48.01 
 
 
370 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
302 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>