233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2394 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  57.82 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  45.11 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.32 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  46.24 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.38 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.15 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.62 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.59 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  40.77 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  44.26 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.08 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.06 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.06 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.23 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.23 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.86 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.38 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  42.48 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.47 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.47 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.94 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.57 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.72 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.46 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.83 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.36 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  34.33 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  34.46 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.21 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  31.67 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  31.67 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  31.67 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  24.62 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  23.87 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  29.73 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  31.73 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  30.77 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  30.18 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3515  uridylate kinase  33.61 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  26 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  29.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  41.25 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  21.1 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  27.97 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  25.58 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  24.9 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  27.5 
 
 		 247 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  23.62 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  30 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  28.81 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  30.08 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  35.37 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  24.66 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  24.88 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  27.87 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  21.76 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  24.1 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  35.37 
 
 		 379 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  26.5 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  25.48 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  21.84 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  35.37 
 
 		 379 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  26.04 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  34.29 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  26.7 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  27.35 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  29.92 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  30.56 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  30.33 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  31.36 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  35.06 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  25.52 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  28.81 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  30.51 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  24.88 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  27.69 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  34.21 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  29.91 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  26.41 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  24.79 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  25 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  30.83 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  25.94 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  27.35 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  23.77 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  25 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  24.52 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  22.58 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  27.63 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  24.58 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  22.82 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  25.55 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  24.58 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  24.8 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  23.64 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  23.17 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>