More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1792 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1792  Patatin  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  48.56 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  45.49 
 
 
283 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  45.49 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  46.4 
 
 
284 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  46.4 
 
 
284 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  44.04 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  46.4 
 
 
284 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  44.04 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  46.4 
 
 
284 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  46.4 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  46.4 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  46.4 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  46.4 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  46.4 
 
 
284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  43.68 
 
 
283 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  45.68 
 
 
284 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  43.32 
 
 
283 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  44.04 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  44.77 
 
 
283 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  42.61 
 
 
290 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  42.25 
 
 
290 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  42.11 
 
 
289 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  43.01 
 
 
290 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  39.44 
 
 
289 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  42.65 
 
 
282 aa  223  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  41.22 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  39.64 
 
 
293 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  39.78 
 
 
293 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  39.64 
 
 
293 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  39.29 
 
 
293 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  38.71 
 
 
304 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  39.74 
 
 
240 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  36.43 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  37.98 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  36.56 
 
 
281 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  35.23 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  34.81 
 
 
313 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  34.63 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  34.4 
 
 
282 aa  162  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  30.55 
 
 
279 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  30.55 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  28.01 
 
 
285 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  32.03 
 
 
284 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30 
 
 
300 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  28.81 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.37 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  28.98 
 
 
290 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  28.62 
 
 
290 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  27.53 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  29.68 
 
 
305 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  26.97 
 
 
287 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  26.91 
 
 
282 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.03 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  30.18 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  27.04 
 
 
638 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  27.41 
 
 
422 aa  85.9  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  25.9 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  27.04 
 
 
424 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.04 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  28.3 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  27.09 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  27.21 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  28.06 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  28.06 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  27.21 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  27.74 
 
 
373 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  28.06 
 
 
364 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  24 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  25.19 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  24.91 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  28.06 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  28.06 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  28.06 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  28.06 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  27.67 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  27.67 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  27.67 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  24.4 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  27.67 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  25.44 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  27.67 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.01 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  22.88 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  23.36 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  23.03 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.35 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  23.05 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.27 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.08 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  22.83 
 
 
383 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  28.72 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.24 
 
 
741 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  30 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  29.48 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  28.86 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  26.94 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  62.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  29.61 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>