23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1171 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  62.5 
 
 		 52 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  53.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  53.66 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  57.14 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 59 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 59 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  52.5 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  52.5 
 
 		 69 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 56 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  47.5 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  37.5 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>