34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2285 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 360 aa  735    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  41.89 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  30.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.47 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.17 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  27.78 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  28.23 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 		 146 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  31.4 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  37.68 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  34.44 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  36.59 
 
 		 94 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  35.21 
 
 		 103 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  43.4 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  23.57 
 
 		 200 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  30.17 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  25.38 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  38.89 
 
 		 88 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  37.5 
 
 		 99 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  31.88 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  27.73 
 
 		 259 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  38.18 
 
 		 88 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2226  putative transmembrane anti-sigma factor  48.21 
 
 		 239 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0399572  normal  0.233287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  31.03 
 
 		 135 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  36.23 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  28.42 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  36.23 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  25.3 
 
 		 86 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2076  putative transmembrane anti-sigma factor  27.07 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000018802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1028  putative transmembrane transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  26.92 
 
 		 87 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>