19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1829 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  27.63 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  26.92 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  23.31 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.69 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.98 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  29.51 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  34.52 
 
 		 461 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  26.01 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 431 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30.65 
 
 		 703 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  24.8 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  26 
 
 		 697 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 443 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  25.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  31.71 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  24 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  28.38 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>