More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1779 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
325 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  87.42 
 
 
326 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.62 
 
 
328 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.52 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.67 
 
 
329 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.44 
 
 
317 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.68 
 
 
410 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.91 
 
 
325 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.91 
 
 
325 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.91 
 
 
325 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.91 
 
 
325 aa  295  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  46.91 
 
 
325 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.91 
 
 
325 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.6 
 
 
325 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  46.6 
 
 
325 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.6 
 
 
325 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  46.6 
 
 
325 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.15 
 
 
325 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.99 
 
 
325 aa  291  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
335 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
335 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  48 
 
 
325 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  44.88 
 
 
341 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.81 
 
 
441 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.01 
 
 
327 aa  275  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  43.12 
 
 
442 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.52 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.64 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.81 
 
 
436 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.14 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.26 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.37 
 
 
329 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.28 
 
 
443 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.67 
 
 
443 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.87 
 
 
334 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.9 
 
 
399 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.3 
 
 
452 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.38 
 
 
448 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.31 
 
 
442 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.69 
 
 
452 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.41 
 
 
447 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.81 
 
 
436 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.29 
 
 
439 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.68 
 
 
325 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.49 
 
 
447 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.6 
 
 
441 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.81 
 
 
335 aa  255  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.67 
 
 
399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.64 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.88 
 
 
441 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.21 
 
 
397 aa  247  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.14 
 
 
320 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.46 
 
 
338 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.17 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.94 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.36 
 
 
364 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.89 
 
 
341 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.36 
 
 
364 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44.86 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  40.12 
 
 
360 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.5 
 
 
328 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.68 
 
 
601 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.2 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.1 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.46 
 
 
374 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.65 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.5 
 
 
313 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.75 
 
 
314 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  40.06 
 
 
367 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.18 
 
 
374 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.27 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.3 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.5 
 
 
610 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.74 
 
 
333 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.94 
 
 
321 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.07 
 
 
368 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.45 
 
 
320 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.33 
 
 
370 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.03 
 
 
318 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.36 
 
 
342 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  44.92 
 
 
318 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.38 
 
 
319 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.26 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.51 
 
 
319 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.46 
 
 
368 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  44.41 
 
 
320 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.35 
 
 
370 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.72 
 
 
315 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.76 
 
 
369 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.79 
 
 
345 aa  225  8e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.56 
 
 
325 aa  225  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.25 
 
 
371 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3574  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.38 
 
 
316 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00172694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
327 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.83 
 
 
317 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  37.76 
 
 
365 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.97 
 
 
369 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.35 
 
 
347 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44 
 
 
319 aa  222  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>