52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1291 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  36.43 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  39.86 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  39.72 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  35.92 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  41.13 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  38.46 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  38.46 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  38.46 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  38.46 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  36.11 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  35.29 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  35.29 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  37.69 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  35.29 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  35.29 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  35.29 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  40 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  35.71 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  33.79 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  33.57 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  39.04 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  34.06 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  34.48 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  34.78 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  32.93 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  33.13 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  32.54 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 297 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  31.93 
 
 		 307 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  31.1 
 
 		 305 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  30.12 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  29.38 
 
 		 989 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  29.38 
 
 		 989 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  30.86 
 
 		 308 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  31.48 
 
 		 300 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  30 
 
 		 990 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  27.65 
 
 		 318 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  28.66 
 
 		 943 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  30.3 
 
 		 835 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  26.99 
 
 		 915 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  28.66 
 
 		 856 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>