50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2226 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  100 
 
 
150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  98.67 
 
 
150 aa  308  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  97.33 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  97.33 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  96.67 
 
 
150 aa  304  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  70.14 
 
 
147 aa  219  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  40.56 
 
 
144 aa  130  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  41.26 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  42.25 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  39.71 
 
 
140 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  36.11 
 
 
149 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  37.14 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  35.29 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  32.41 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  38.35 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  29.51 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  32.67 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  32.17 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  28.28 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01895  hypothetical protein  48.33 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  31.47 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1056  hypothetical protein  49.12 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  29.66 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  29.66 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  28.97 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  45 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  27.59 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  25.66 
 
 
293 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  24.55 
 
 
301 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  27.65 
 
 
319 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  25.9 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  28.24 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  27.33 
 
 
313 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 
313 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  26.35 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  26.28 
 
 
327 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  28.05 
 
 
298 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0251  GTP-binding protein Era  30.43 
 
 
295 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.338146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  23.31 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  26.47 
 
 
318 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>