47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2233 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  98.67 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  97.33 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  97.33 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  96.67 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  70.83 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  40.56 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  41.26 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  42.25 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  39.71 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  36.17 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  35.29 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  32.41 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  38.35 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  32.17 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  32.17 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  29.51 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  32.67 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  31.47 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01895  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  28.28 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  29.66 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  28.97 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1056  hypothetical protein  50.88 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  46.67 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  27.59 
 
 		 178 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  26.8 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  27.06 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  23.95 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  27.78 
 
 		 313 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  28.24 
 
 		 308 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  25.3 
 
 		 310 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  27.22 
 
 		 327 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  27.39 
 
 		 313 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  32.31 
 
 		 345 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  23.31 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>