47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2297 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  100 
 
 
147 aa  306  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  70.83 
 
 
150 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  70.83 
 
 
150 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  70.14 
 
 
150 aa  219  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  70.83 
 
 
150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  70.14 
 
 
150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  41.26 
 
 
144 aa  130  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  42.25 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1056  hypothetical protein  91.8 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  43.66 
 
 
142 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01895  hypothetical protein  90 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2144  eutP/pduV family protein  86.67 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 
149 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  36.43 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  41.58 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  35.21 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  34.06 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  35.71 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2861  hypothetical protein  89.74 
 
 
39 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0469704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  31.88 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  35.34 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  29.71 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  30.82 
 
 
178 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  30 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  32.52 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  32.52 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  32.52 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  32.52 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  31.71 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  25.3 
 
 
305 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  29.76 
 
 
314 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  27.56 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  24.54 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  25.66 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  28.28 
 
 
298 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3882  GTP-binding protein Era  26.75 
 
 
385 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  27.22 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  26.47 
 
 
314 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>