39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2053 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  40.48 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  43.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  43.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  43.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  38.89 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  44.3 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  43.84 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  41.56 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  38.27 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  40.26 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  38.27 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  39.47 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  38.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  38.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  39.47 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  38.67 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  31.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  41.38 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  41.38 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  31.31 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  44.07 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  29.29 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  33.82 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.34 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  31.51 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  32.81 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  30.14 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  30.14 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  25.81 
 
 		 159 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>