34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1424 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 635 aa  1221    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  25.54 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  27.32 
 
 		 418 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  28.19 
 
 		 501 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  32.56 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  25.97 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  32.93 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  25.41 
 
 		 707 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  36.79 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  30.46 
 
 		 547 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  31.47 
 
 		 1244 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  27.81 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  50 
 
 		 530 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  50 
 
 		 532 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1812  zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 		 531 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  25.86 
 
 		 322 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  43.59 
 
 		 588 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0995  MJ0042 family finger-like protein  51.43 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.688512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  51.43 
 
 		 594 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  26.5 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  51.43 
 
 		 593 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  45 
 
 		 318 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  34.12 
 
 		 1144 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  44.44 
 
 		 986 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 1163 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 		 1139 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  48.65 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  25.83 
 
 		 256 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  23.12 
 
 		 256 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  35.71 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  21.95 
 
 		 239 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  34 
 
 		 236 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>