29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1839 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 986 aa  1926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  34.57 
 
 		 479 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4345  MJ0042 family finger-like protein  42.34 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.861671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  42.34 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  42.34 
 
 		 392 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  39.66 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  55.26 
 
 		 530 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  55.26 
 
 		 532 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  43.9 
 
 		 605 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  42.5 
 
 		 547 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 707 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 694 aa  54.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1812  zinc finger/thioredoxin putative  57.14 
 
 		 531 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  39.02 
 
 		 560 aa  52.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  41.03 
 
 		 547 aa  52.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 339 aa  52.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 635 aa  52.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  41.46 
 
 		 610 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  30.93 
 
 		 575 aa  51.6  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 		 571 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  39.47 
 
 		 417 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 279 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  34.15 
 
 		 501 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  38.46 
 
 		 1163 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4236  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48 
 
 		 570 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000155192  unclonable  0.0000114399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  38.46 
 
 		 1144 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  38.46 
 
 		 1139 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  38.46 
 
 		 383 aa  44.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>