151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0780 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  100 
 
 		 173 aa  340  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  30.41 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  28.25 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  32.45 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  29.48 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  32.48 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  34.06 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  37.59 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  36.09 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  31.97 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  29.75 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  30.38 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  32.17 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  34.19 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  33.04 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  31.62 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  31.67 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  28.46 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  24.4 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  27.16 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  32.23 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  27.16 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  31.16 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  35.16 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  31.71 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  28.1 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  28.68 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  28.05 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  37.8 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  31.88 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.25 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  28.05 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  32.76 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  31.96 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.04 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  33.77 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  26.79 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  33.33 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  32.03 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  27.42 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  33.33 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  29.91 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  32.81 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  30.15 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  28.3 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  29.75 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  29.25 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  33.58 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  26.4 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  26.9 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  32.09 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  27.34 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  32.79 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  27.27 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  27.27 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  30.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  30.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  30.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  29.51 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  30.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  30.6 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  29.93 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  29.93 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  31.75 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  33.91 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  30.77 
 
 		 195 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25.16 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  29.93 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  31.94 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  31.54 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  28.81 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  30.16 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  32.81 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  31.9 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  26.28 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  24.85 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  31.15 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  28.03 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  31.15 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  33.08 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  27.42 
 
 		 248 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  33.01 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  30.77 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  26.28 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  28.79 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  25.55 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  32.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  32.04 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  32.04 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  25.44 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  32.04 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  31.14 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  28.03 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  28.03 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  28.03 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>