More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0196 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  812    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0025  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  50.9 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380385  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2469  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  49.55 
 
 		 358 aa  358  9e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00523376  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1336  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  49.55 
 
 		 373 aa  353  4e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1176  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  48.66 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2583  respiratory nitrate reductase beta subunit  43.95 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68171  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  41.99 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.54 
 
 		 473 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  35 
 
 		 513 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  35 
 
 		 513 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.68 
 
 		 511 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  34.76 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  35.31 
 
 		 512 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  34.29 
 
 		 512 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  36.89 
 
 		 489 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1707  nitrate reductase, beta subunit  36.89 
 
 		 489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  36.2 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2171  respiratory nitrate reductase beta subunit  36.59 
 
 		 489 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  34.81 
 
 		 473 aa  236  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.52 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  34.99 
 
 		 521 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  33.18 
 
 		 508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  34.12 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  33.41 
 
 		 511 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  34.68 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  34.58 
 
 		 526 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  34.2 
 
 		 514 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  34.68 
 
 		 511 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  33.65 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  34.68 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  34.68 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  35.44 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  34.2 
 
 		 514 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.66 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  34.52 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  34.2 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  34.2 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  34.2 
 
 		 514 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  33.1 
 
 		 511 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  32.85 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  33.25 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  35.19 
 
 		 512 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  35.19 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  35.19 
 
 		 512 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  35.19 
 
 		 512 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  34.12 
 
 		 509 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  35.19 
 
 		 512 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  35.7 
 
 		 512 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  34.05 
 
 		 514 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.81 
 
 		 519 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  35.19 
 
 		 512 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  35.7 
 
 		 512 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  32.37 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  33.1 
 
 		 512 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  32.85 
 
 		 491 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  32.85 
 
 		 491 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  33.18 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  35.19 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0330  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.47 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000947818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.09 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  33.57 
 
 		 554 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  32.77 
 
 		 588 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  33.25 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  35.88 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  31.89 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  34.67 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  35.37 
 
 		 507 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.57 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.57 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  33.9 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  36.39 
 
 		 507 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.29 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  33.25 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  35.37 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  31.68 
 
 		 519 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  31.68 
 
 		 519 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  35.37 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  35.4 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  35.24 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.1 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.24 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.02 
 
 		 508 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  35.46 
 
 		 509 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.66 
 
 		 584 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  32.13 
 
 		 489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.29 
 
 		 544 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  33.41 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  33.1 
 
 		 504 aa  226  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  33.41 
 
 		 514 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  32.13 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  34.41 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  33.1 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.86 
 
 		 557 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  32.47 
 
 		 517 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>