34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1283 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1283  DNA invertase/resolvase  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1298  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0238352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1293  DNA invertase/resolvase  32.58 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00017233  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  27.89 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.26 
 
 		 458 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  33.04 
 
 		 515 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  26.4 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.41 
 
 		 458 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.45 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  26.02 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  36 
 
 		 546 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  27.92 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.1 
 
 		 485 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 540 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  34.25 
 
 		 862 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  29.2 
 
 		 550 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  27.55 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  29.2 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  24.76 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 517 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.33 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  27.14 
 
 		 198 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 201 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  27.13 
 
 		 181 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  32.89 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>