83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4619 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 416 aa  835    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  58.6 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  58.93 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  57.26 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  50 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  46.34 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  39.6 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  38.79 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  38.12 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  36.89 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  35.2 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  36.22 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.33 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  36.44 
 
 		 403 aa  206  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  35.92 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  37.6 
 
 		 402 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  37.71 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  36.62 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  35.03 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  34.84 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.1 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  32.41 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.88 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  33.88 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.46 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  36.01 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  34.79 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  34.04 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  34.13 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  34.24 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  33.88 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.2 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.15 
 
 		 729 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  31.73 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  31.69 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.43 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  31.46 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.68 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  31.73 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.79 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.41 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.31 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.04 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  30.91 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 744 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.48 
 
 		 731 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.79 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.47 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  30.26 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  31.11 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  30.86 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.23 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.18 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.18 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  25.92 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.38 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3654  polysulphide reductase-like protein  31.02 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  26.75 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  29.28 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  30.48 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  28.08 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  26.9 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  28.08 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  27.07 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  26.61 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  27.92 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  26.36 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24.45 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.47 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.59 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>