More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3199 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2219  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.99 
 
 
820 aa  647    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3391  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.12 
 
 
843 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4976  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  791    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2722  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.25 
 
 
843 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.18 
 
 
802 aa  780    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  45.88 
 
 
836 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.7 
 
 
843 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.96757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  47.48 
 
 
817 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  44.9 
 
 
832 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0558  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.71 
 
 
828 aa  753    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.371479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  792    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.71 
 
 
828 aa  728    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4706  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.68 
 
 
802 aa  793    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  42.86 
 
 
816 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  791    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  792    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  43.1 
 
 
816 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0789  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.73 
 
 
818 aa  696    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.13 
 
 
848 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1050  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.42 
 
 
809 aa  784    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.4 
 
 
832 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00073927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.19 
 
 
816 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0227  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.89 
 
 
815 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0255274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0411  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
827 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.908979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.94 
 
 
838 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.96 
 
 
835 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.97 
 
 
815 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.23 
 
 
833 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0518107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.47 
 
 
823 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.93 
 
 
816 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  791    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.82 
 
 
859 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.731107  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.94 
 
 
844 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.02 
 
 
826 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3199  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
811 aa  1677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.15 
 
 
841 aa  689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.24 
 
 
842 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0242  glycogen phosphorylase  51.55 
 
 
802 aa  795    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239984  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.4 
 
 
818 aa  711    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0913  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.66 
 
 
841 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0554  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.56 
 
 
820 aa  782    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.21 
 
 
817 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.85 
 
 
846 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.85 
 
 
846 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  47.61 
 
 
817 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5267  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.35 
 
 
839 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0440049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1771  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.52 
 
 
832 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0562  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.93 
 
 
804 aa  789    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0359  Phosphorylase  45.12 
 
 
824 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.262429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5005  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  792    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0228  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.13 
 
 
831 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.44 
 
 
808 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.93 
 
 
816 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  54.23 
 
 
811 aa  857    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5031  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.68 
 
 
845 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2246  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.81 
 
 
824 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.71978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.46 
 
 
850 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.41 
 
 
849 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4995  glycogen phosphorylase  51.43 
 
 
802 aa  792    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1983  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.14 
 
 
836 aa  688    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000313415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0727  glycogen phosphorylase  51.13 
 
 
800 aa  745    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0939464  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2385  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.12 
 
 
847 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.54 
 
 
832 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.41 
 
 
838 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  42.23 
 
 
829 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2334  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.12 
 
 
847 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0909  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.78 
 
 
841 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631457  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.32 
 
 
817 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.36 
 
 
833 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.68 
 
 
829 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.05 
 
 
816 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2235  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.36 
 
 
842 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.19 
 
 
834 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1992  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.68 
 
 
842 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000769709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.53 
 
 
839 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.54 
 
 
840 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49 
 
 
822 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3904  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304876  normal  0.462379 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3801  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3843  glycogen phosphorylase  45.83 
 
 
815 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.400184  normal  0.614217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3735  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45650  glycogen phosphorylase  42.8 
 
 
815 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3724  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03233  hypothetical protein  45.65 
 
 
815 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.31 
 
 
816 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.76 
 
 
815 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4740  glycogen phosphorylase  45.51 
 
 
815 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0176  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.35 
 
 
828 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23902  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  44.75 
 
 
817 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  42.04 
 
 
870 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  43.98 
 
 
820 aa  626  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  45.76 
 
 
815 aa  628  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>